Babası klasik filolog ve ilahiyatçı Emil August Niese'ydi. Charlotte, Eckernförde'deki ortaokullarda öğretmenlik yapmasını sağlayacak sınavı başardı ve sonrası değişik okullarda öğretmenlik yaptı. 

1881'de Plön'deki annesi ve büyükbabasının yanına taşındı ve başlangıçta erkek takma adı Lucian Bürger ile kendi edebi eserlerini yayınlamaya başladı. Ancak yazar olarak geçimini sağlayana kadar öğretmenlik yaptı.

1884'te akrabalarının yaşadığı Altona'ya, sonra da Ottensen'e yerleşti. Charlotte Niese ünlü bir yazar olduğu için öğretmenliği bıraktı.  

Edebi eserlerinin tamamında kadınların eğitim ve mesleki fırsatlarını iyileştirmeye kendini adamakla kalmadı, aynı zamanda Altona'daki Kuzey Almanya Kadın Dernekleri yerel şubesinin geçici olarak başkanıydı.

Çocukken, altı erkek kardeşinin hepsinin yüksek eğitim aldığını ve bilimsel kariyerlere başladığını deneyimlemiş, kendisi ve kız kardeşi ise bundan mahrum bırakılmıştı. Sonuçta, kadınların sosyal sınırları vardı ve toplumsal yapı bu sınırların aşılmasına uygun değildi.

Eserlerinde bu konuyu işlemesine, teorik olarak kadın erkek eşitliğinden yana olmasına rağmen pratikte politik tavır almaktan, kendi hayatını değiştirmekten çekindi.

En politik tavrı evinin bulunduğu sokaktan tramvay geçmesine karşı başlatılan bir protesto mektubu yazmaktı.

Charlotte Niese, 1935 yılında inzivaya çekilmiş halde şiir ve düz yazılarını yazmaya devam ederken öldü.